|
Residue conformations |
|
R1 : G C3p_endo anti |
|
R2 : G C3p_endo anti |
|
R3 : C C3p_endo anti |
|
R4 : G C3p_endo anti |
|
R5 : C C3p_endo anti |
|
R6 : G C3p_endo anti |
|
R7 : U C4p_exo anti |
|
R8 : 4SU |
|
R9 : A C2p_endo syn |
|
R10 : A C3p_endo anti |
|
R11 : C C3p_endo anti |
|
R12 : A C3p_endo anti |
|
R13 : A C3p_endo anti |
|
R14 : A C3p_endo anti |
|
R15 : G C3p_endo anti |
|
R16 : C C3p_endo anti |
|
R18 : G C2p_endo anti |
|
R19 : G C2p_endo anti |
|
R20 : H2U |
|
R21 : H2U |
|
R22 : A C2p_exo anti |
|
R23 : U C3p_endo anti |
|
R24 : G C3p_endo anti |
|
R25 : U C3p_endo anti |
|
R26 : A C3p_endo anti |
|
R27 : G C3p_endo anti |
|
R28 : C C3p_endo anti |
|
R29 : G C3p_endo anti |
|
R30 : G C3p_endo anti |
|
R31 : A C3p_endo anti |
|
R32 : PSU |
|
R33 : U C3p_endo anti |
|
R34 : G C3p_endo anti |
|
R35 : C C3p_endo anti |
|
R36 : A C3p_endo anti |
|
R37 : MIA |
|
R38 : A C3p_endo anti |
|
R39 : PSU |
|
R40 : C C3p_endo anti |
|
R41 : C C3p_endo anti |
|
R42 : G C3p_endo anti |
|
R43 : U C3p_endo anti |
|
R44 : C C2p_endo anti |
|
R45 : U C2p_endo anti |
|
R46 : A C2p_exo anti |
|
R48 : G C2p_endo anti |
|
R49 : U C3p_endo anti |
|
R50 : C C3p_endo anti |
|
R51 : C C3p_endo anti |
|
R52 : G C3p_endo anti |
|
R53 : G C3p_endo anti |
|
R54 : 5MU |
|
R55 : PSU |
|
R56 : C C3p_endo anti |
|
R57 : G C3p_endo anti |
|
R58 : A C2p_endo syn |
|
R59 : C C3p_endo anti |
|
R60 : U C2p_endo anti |
|
R61 : C C3p_endo anti |
|
R62 : C C3p_endo anti |
|
R63 : G C2p_exo anti |
|
R64 : G C3p_endo anti |
|
R65 : A C3p_endo anti |
|
R66 : A C3p_endo anti |
|
R67 : C C3p_endo anti |
|
R68 : G C3p_endo anti |
|
R69 : C C3p_endo anti |
|
R70 : G C3p_endo anti |
|
R71 : C C3p_endo anti |
|
R72 : C C3p_endo anti |
|
R73 : U C3p_endo anti |
|
R74 : C C3p_endo anti |
|
R75 : C C3p_exo anti |
|
R76 : A C2p_endo anti |
|
P1 : ALA |
|
P2 : LYS |
|
P3 : GLY |
|
P4 : GLU |
|
P5 : PHE |
|
P6 : ILE |
|
P7 : ARG |
|
P8 : THR |
|
P9 : LYS |
|
P10 : PRO |
|
P11 : HIS |
|
P12 : VAL |
|
P13 : ASN |
|
P14 : VAL |
|
P15 : GLY |
|
P16 : THR |
|
P17 : ILE |
|
P18 : GLY |
|
P19 : HIS |
|
P20 : VAL |
|
P21 : ASP |
|
P22 : HIS |
|
P23 : GLY |
|
P24 : LYS |
|
P25 : THR |
|
P26 : THR |
|
P27 : LEU |
|
P28 : THR |
|
P29 : ALA |
|
P30 : ALA |
|
P31 : LEU |
|
P32 : THR |
|
P33 : TYR |
|
P34 : VAL |
|
P35 : ALA |
|
P36 : ALA |
|
P37 : ALA |
|
P38 : GLU |
|
P39 : ASN |
|
P40 : PRO |
|
P41 : ASN |
|
P42 : VAL |
|
P43 : GLU |
|
P44 : VAL |
|
P45 : LYS |
|
P46 : ASP |
|
P47 : TYR |
|
P48 : GLY |
|
P49 : ASP |
|
P50 : ILE |
|
P51 : ASP |
|
P52 : LYS |
|
P53 : ALA |
|
P54 : PRO |
|
P55 : GLU |
|
P56 : GLU |
|
P57 : ARG |
|
P58 : ALA |
|
P59 : ARG |
|
P60 : GLY |
|
P61 : ILE |
|
P62 : THR |
|
P63 : ILE |
|
P64 : ASN |
|
P65 : THR |
|
P66 : ALA |
|
P67 : HIS |
|
P68 : VAL |
|
P69 : GLU |
|
P70 : TYR |
|
P71 : GLU |
|
P72 : THR |
|
P73 : ALA |
|
P74 : LYS |
|
P75 : ARG |
|
P76 : HIS |
|
P77 : TYR |
|
P78 : SER |
|
P79 : HIS |
|
P80 : VAL |
|
P81 : ASP |
|
P82 : CYS |
|
P83 : PRO |
|
P84 : GLY |
|
P85 : HIS |
|
P86 : ALA |
|
P87 : ASP |
|
P88 : TYR |
|
P89 : ILE |
|
P90 : LYS |
|
P91 : ASN |
|
P92 : MET |
|
P93 : ILE |
|
P94 : THR |
|
P95 : GLY |
|
P96 : ALA |
|
P97 : ALA |
|
P98 : GLN |
|
P99 : MET |
|
P100 : ASP |
|
P101 : GLY |
|
P102 : ALA |
|
P103 : ILE |
|
P104 : LEU |
|
P105 : VAL |
|
P106 : VAL |
|
P107 : SER |
|
P108 : ALA |
|
P109 : ALA |
|
P110 : ASP |
|
P111 : GLY |
|
P112 : PRO |
|
P113 : MET |
|
P114 : PRO |
|
P115 : GLN |
|
P116 : THR |
|
P117 : ARG |
|
P118 : GLU |
|
P119 : HIS |
|
P120 : ILE |
|
P121 : LEU |
|
P122 : LEU |
|
P123 : ALA |
|
P124 : ARG |
|
P125 : GLN |
|
P126 : VAL |
|
P127 : GLY |
|
P128 : VAL |
|
P129 : PRO |
|
P130 : TYR |
|
P131 : ILE |
|
P132 : VAL |
|
P133 : VAL |
|
P134 : PHE |
|
P135 : MET |
|
P136 : ASN |
|
P137 : LYS |
|
P138 : VAL |
|
P139 : ASP |
|
P140 : MET |
|
P141 : VAL |
|
P142 : ASP |
|
P143 : ASP |
|
P144 : PRO |
|
P145 : GLU |
|
P146 : LEU |
|
P147 : LEU |
|
P148 : ASP |
|
P149 : LEU |
|
P150 : VAL |
|
P151 : GLU |
|
P152 : MET |
|
P153 : GLU |
|
P154 : VAL |
|
P155 : ARG |
|
P156 : ASP |
|
P157 : LEU |
|
P158 : LEU |
|
P159 : ASN |
|
P160 : GLN |
|
P161 : TYR |
|
P162 : GLU |
|
P163 : PHE |
|
P164 : PRO |
|
P165 : GLY |
|
P166 : ASP |
|
P167 : GLU |
|
P168 : VAL |
|
P169 : PRO |
|
P170 : VAL |
|
P171 : ILE |
|
P172 : ARG |
|
P173 : GLY |
|
P174 : SER |
|
P175 : ALA |
|
P176 : LEU |
|
P177 : LEU |
|
P178 : ALA |
|
P179 : LEU |
|
P180 : GLU |
|
P181 : GLU |
|
P182 : MET |
|
P183 : HIS |
|
P184 : LYS |
|
P185 : ASN |
|
P186 : PRO |
|
P187 : LYS |
|
P188 : THR |
|
P189 : LYS |
|
P190 : ARG |
|
P191 : GLY |
|
P192 : GLU |
|
P193 : ASN |
|
P194 : GLU |
|
P195 : TRP |
|
P196 : VAL |
|
P197 : ASP |
|
P198 : LYS |
|
P199 : ILE |
|
P200 : TRP |
|
P201 : GLU |
|
P202 : LEU |
|
P203 : LEU |
|
P204 : ASP |
|
P205 : ALA |
|
P206 : ILE |
|
P207 : ASP |
|
P208 : GLU |
|
P209 : TYR |
|
P210 : ILE |
|
P211 : PRO |
|
P212 : THR |
|
P213 : PRO |
|
P214 : VAL |
|
P215 : ARG |
|
P216 : ASP |
|
P217 : VAL |
|
P218 : ASP |
|
P219 : LYS |
|
P220 : PRO |
|
P221 : PHE |
|
P222 : LEU |
|
P223 : MET |
|
P224 : PRO |
|
P225 : VAL |
|
P226 : GLU |
|
P227 : ASP |
|
P228 : VAL |
|
P229 : PHE |
|
P230 : THR |
|
P231 : ILE |
|
P232 : THR |
|
P233 : GLY |
|
P234 : ARG |
|
P235 : GLY |
|
P236 : THR |
|
P237 : VAL |
|
P238 : ALA |
|
P239 : THR |
|
P240 : GLY |
|
P241 : ARG |
|
P242 : ILE |
|
P243 : GLU |
|
P244 : ARG |
|
P245 : GLY |
|
P246 : LYS |
|
P247 : VAL |
|
P248 : LYS |
|
P249 : VAL |
|
P250 : GLY |
|
P251 : ASP |
|
P252 : GLU |
|
P253 : VAL |
|
P254 : GLU |
|
P255 : ILE |
|
P256 : VAL |
|
P257 : GLY |
|
P258 : LEU |
|
P259 : ALA |
|
P260 : PRO |
|
P261 : GLU |
|
P262 : THR |
|
P263 : ARG |
|
P264 : LYS |
|
P265 : THR |
|
P266 : VAL |
|
P267 : VAL |
|
P268 : THR |
|
P269 : GLY |
|
P270 : VAL |
|
P271 : GLU |
|
P272 : MET |
|
P273 : HIS |
|
P274 : ARG |
|
P275 : LYS |
|
P276 : THR |
|
P277 : LEU |
|
P278 : GLN |
|
P279 : GLU |
|
P280 : GLY |
|
P281 : ILE |
|
P282 : ALA |
|
P283 : GLY |
|
P284 : ASP |
|
P285 : ASN |
|
P286 : VAL |
|
P287 : GLY |
|
P288 : LEU |
|
P289 : LEU |
|
P290 : LEU |
|
P291 : ARG |
|
P292 : GLY |
|
P293 : VAL |
|
P294 : SER |
|
P295 : ARG |
|
P296 : GLU |
|
P297 : GLU |
|
P298 : VAL |
|
P299 : GLU |
|
P300 : ARG |
|
P301 : GLY |
|
P302 : GLN |
|
P303 : VAL |
|
P304 : LEU |
|
P305 : ALA |
|
P306 : LYS |
|
P307 : PRO |
|
P308 : GLY |
|
P309 : SER |
|
P310 : ILE |
|
P311 : THR |
|
P312 : PRO |
|
P313 : HIS |
|
P314 : THR |
|
P315 : LYS |
|
P316 : PHE |
|
P317 : GLU |
|
P318 : ALA |
|
P319 : SER |
|
P320 : VAL |
|
P321 : TYR |
|
P322 : ILE |
|
P323 : LEU |
|
P324 : LYS |
|
P325 : LYS |
|
P326 : GLU |
|
P327 : GLU |
|
P328 : GLY |
|
P329 : GLY |
|
P330 : ARG |
|
P331 : HIS |
|
P332 : THR |
|
P333 : GLY |
|
P334 : PHE |
|
P335 : PHE |
|
P336 : THR |
|
P337 : GLY |
|
P338 : TYR |
|
P339 : ARG |
|
P340 : PRO |
|
P341 : GLN |
|
P342 : PHE |
|
P343 : TYR |
|
P344 : PHE |
|
P345 : ARG |
|
P346 : THR |
|
P347 : THR |
|
P348 : ASP |
|
P349 : VAL |
|
P350 : THR |
|
P351 : GLY |
|
P352 : VAL |
|
P353 : VAL |
|
P354 : ARG |
|
P355 : LEU |
|
P356 : PRO |
|
P357 : GLN |
|
P358 : GLY |
|
P359 : VAL |
|
P360 : GLU |
|
P361 : MET |
|
P362 : VAL |
|
P363 : MET |
|
P364 : PRO |
|
P365 : GLY |
|
P366 : ASP |
|
P367 : ASN |
|
P368 : VAL |
|
P369 : THR |
|
P370 : PHE |
|
P371 : THR |
|
P372 : VAL |
|
P373 : GLU |
|
P374 : LEU |
|
P375 : ILE |
|
P376 : LYS |
|
P377 : PRO |
|
P378 : VAL |
|
P379 : ALA |
|
P380 : LEU |
|
P381 : GLU |
|
P382 : GLU |
|
P383 : GLY |
|
P384 : LEU |
|
P385 : ARG |
|
P386 : PHE |
|
P387 : ALA |
|
P388 : ILE |
|
P389 : ARG |
|
P390 : GLU |
|
P391 : GLY |
|
P392 : GLY |
|
P393 : ARG |
|
P394 : THR |
|
P395 : VAL |
|
P396 : GLY |
|
P397 : ALA |
|
P398 : GLY |
|
P399 : VAL |
|
P400 : VAL |
|
P401 : THR |
|
P402 : LYS |
|
P403 : ILE |
|
P404 : LEU |
|
P405 : GLU |
|
R77 : MG |
|
R179 : MG |
|
R976 : CYS |
|
P407 : MG |
|
P408 : SO4 |
|
P409 : SO4 |
|
P406 : GNP |
|
R977 : HOH |
|
R978 : HOH |
|
R979 : HOH |
|
R980 : HOH |
|
R981 : HOH |
|
R982 : HOH |
|
R983 : HOH |
|
R984 : HOH |
|
R985 : HOH |
|
R986 : HOH |
|
R987 : HOH |
|
R988 : HOH |
|
R989 : HOH |
|
R990 : HOH |
|
R991 : HOH |
|
R992 : HOH |
|
R993 : HOH |
|
R994 : HOH |
|
R995 : HOH |
|
R996 : HOH |
|
R997 : HOH |
|
R998 : HOH |
|
R999 : HOH |
|
R1000 : HOH |
|
R1001 : HOH |
|
R1002 : HOH |
|
R1003 : HOH |
|
R1004 : HOH |
|
R1005 : HOH |
|
R1006 : HOH |
|
R1007 : HOH |
|
R1008 : HOH |
|
R1009 : HOH |
|
R1010 : HOH |
|
R1011 : HOH |
|
R1012 : HOH |
|
R1013 : HOH |
|
R1014 : HOH |
|
R1015 : HOH |
|
R1016 : HOH |
|
R1017 : HOH |
|
R1018 : HOH |
|
R1019 : HOH |
|
R1020 : HOH |
|
R1021 : HOH |
|
R1022 : HOH |
|
R1023 : HOH |
|
R1024 : HOH |
|
R1025 : HOH |
|
R1026 : HOH |
|
R1027 : HOH |
|
R1028 : HOH |
|
R1029 : HOH |
|
R1030 : HOH |
|
R1031 : HOH |
|
R1032 : HOH |
|
R1033 : HOH |
|
R1034 : HOH |
|
R1035 : HOH |
|
R1036 : HOH |
|
R1037 : HOH |
|
R1038 : HOH |
|
R1039 : HOH |
|
R1040 : HOH |
|
R1041 : HOH |
|
R1042 : HOH |
|
R1043 : HOH |
|
R1044 : HOH |
|
R1045 : HOH |
|
R1046 : HOH |
|
R1047 : HOH |
|
R1048 : HOH |
|
R1049 : HOH |
|
R1050 : HOH |
|
R1051 : HOH |
|
R1052 : HOH |
|
R1053 : HOH |
|
R1054 : HOH |
|
R1055 : HOH |
|
R1056 : HOH |
|
R1057 : HOH |
|
R1058 : HOH |
|
R1059 : HOH |
|
R1060 : HOH |
|
R1061 : HOH |
|
R1062 : HOH |
|
R1063 : HOH |
|
P410 : HOH |
|
P411 : HOH |
|
P412 : HOH |
|
P413 : HOH |
|
P414 : HOH |
|
P415 : HOH |
|
P416 : HOH |
|
P417 : HOH |
|
P418 : HOH |
|
P419 : HOH |
|
P420 : HOH |
|
P421 : HOH |
|
P422 : HOH |
|
P423 : HOH |
|
P424 : HOH |
|
P425 : HOH |
|
P426 : HOH |
|
P427 : HOH |
|
P428 : HOH |
|
P429 : HOH |
|
P430 : HOH |
|
P431 : HOH |
|
P432 : HOH |
|
P433 : HOH |
|
P434 : HOH |
|
P435 : HOH |
|
P436 : HOH |
|
P437 : HOH |
|
P438 : HOH |
|
P439 : HOH |
|
P440 : HOH |
|
P441 : HOH |
|
P442 : HOH |
|
P443 : HOH |
|
P444 : HOH |
|
P445 : HOH |
|
P446 : HOH |
|
P447 : HOH |
|
P448 : HOH |
|
P449 : HOH |
|
P450 : HOH |
|
P451 : HOH |
|
P452 : HOH |
|
P453 : HOH |
|
P454 : HOH |
|
P455 : HOH |
|
P456 : HOH |
|
P457 : HOH |
|
P458 : HOH |
|
P459 : HOH |
|
P460 : HOH |
|
P461 : HOH |
|
P462 : HOH |
|
P463 : HOH |
|
P464 : HOH |
|
P465 : HOH |
|
P466 : HOH |
|
P467 : HOH |
|
P468 : HOH |
|
P469 : HOH |
|
P470 : HOH |
|
P471 : HOH |
|
P472 : HOH |
|
P473 : HOH |
|
P474 : HOH |
|
P475 : HOH |
|
P476 : HOH |
|
P477 : HOH |
|
P478 : HOH |
|
P479 : HOH |
|
P480 : HOH |
|
P481 : HOH |
|
P482 : HOH |
|
P483 : HOH |
|
P484 : HOH |
|
P485 : HOH |
|
P486 : HOH |
|
P487 : HOH |
|
P488 : HOH |
|
P489 : HOH |
|
P490 : HOH |
|
P491 : HOH |
|
P492 : HOH |
|
P493 : HOH |
|
P494 : HOH |
|
P495 : HOH |
|
P496 : HOH |
|
P497 : HOH |
|
P498 : HOH |
|
P499 : HOH |
|
P500 : HOH |
|
P501 : HOH |
|
P502 : HOH |
|
P503 : HOH |
|
P504 : HOH |
|
P505 : HOH |
|
P506 : HOH |
|
P507 : HOH |
|
P508 : HOH |
|
P509 : HOH |
|
P510 : HOH |
|
P511 : HOH |
|
P512 : HOH |
|
P513 : HOH |
|
P514 : HOH |
|
P515 : HOH |
|
P516 : HOH |
|
P517 : HOH |
|
P518 : HOH |
|
P519 : HOH |
|
P520 : HOH |
|
P521 : HOH |
|
P522 : HOH |
|
P523 : HOH |
|
P524 : HOH |
|
P525 : HOH |
|
P526 : HOH |
|
P527 : HOH |
|
P528 : HOH |
|
P529 : HOH |
|
P530 : HOH |
|
P531 : HOH |
|
P532 : HOH |
|
P533 : HOH |
|
P534 : HOH |
|
P535 : HOH |
|
P536 : HOH |
|
P537 : HOH |
|
P538 : HOH |
|
P539 : HOH |
|
P540 : HOH |
|
P541 : HOH |
|
P542 : HOH |
|
P543 : HOH |
|
P544 : HOH |
|
P545 : HOH |
|
P546 : HOH |
|
P547 : HOH |
|
P548 : HOH |
|
P549 : HOH |
|
P550 : HOH |
|
P551 : HOH |
|
P552 : HOH |
|
P553 : HOH |
|
P554 : HOH |
|
P555 : HOH |
|
P556 : HOH |
|
P557 : HOH |
|
P558 : HOH |
|
P559 : HOH |
|
P560 : HOH |
|
P561 : HOH |
|
P562 : HOH |
|
P563 : HOH |
|
P564 : HOH |
|
P565 : HOH |
|
P566 : HOH |
|
P567 : HOH |
|
P568 : HOH |
|
P569 : HOH |
|
P570 : HOH |
|
P571 : HOH |
|
P572 : HOH |
|
P573 : HOH |
|
P574 : HOH |
|
P575 : HOH |
|
P576 : HOH |
|
P577 : HOH |
|
P578 : HOH |
|
P579 : HOH |
|
P580 : HOH |
|
P581 : HOH |
|
P582 : HOH |
|
P583 : HOH |
|
Adjacent stackings |
|
R1-R2 : adjacent_5p upward |
|
R2-R3 : adjacent_5p upward |
|
R4-R5 : adjacent_5p upward |
|
R10-R11 : adjacent_5p upward |
|
R12-R13 : adjacent_5p upward |
|
R14-R15 : adjacent_5p upward |
|
R15-R16 : adjacent_5p upward |
|
R22-R23 : adjacent_5p upward |
|
R24-R25 : adjacent_5p upward |
|
R25-R26 : adjacent_5p upward |
|
R26-R27 : adjacent_5p upward |
|
R27-R28 : adjacent_5p upward |
|
R28-R29 : adjacent_5p upward |
|
R29-R30 : adjacent_5p upward |
|
R30-R31 : adjacent_5p upward |
|
R34-R35 : adjacent_5p upward |
|
R41-R42 : adjacent_5p upward |
|
R42-R43 : adjacent_5p upward |
|
R43-R44 : adjacent_5p upward |
|
R46-R48 : adjacent_5p upward |
|
R49-R50 : adjacent_5p upward |
|
R50-R51 : adjacent_5p upward |
|
R52-R53 : adjacent_5p upward |
|
R56-R57 : adjacent_5p upward |
|
R59-R60 : adjacent_5p upward |
|
R63-R64 : adjacent_5p upward |
|
R64-R65 : adjacent_5p upward |
|
R65-R66 : adjacent_5p upward |
|
R66-R67 : adjacent_5p upward |
|
R67-R68 : adjacent_5p upward |
|
R68-R69 : adjacent_5p upward |
|
R69-R70 : adjacent_5p upward |
|
R70-R71 : adjacent_5p upward |
|
R73-R74 : adjacent_5p upward |
|
Non-Adjacent stackings |
|
R4-R70 : outward |
|
R6-R68 : outward |
|
R7-R49 : upward |
|
R9-R46 : outward |
|
R10-R26 : outward |
|
R12-R24 : outward |
|
R14-R22 : outward |
|
R18-R57 : inward pairing |
|
R18-R58 : outward |
|
R19-R57 : outward |
|
R29-R42 : outward |
|
R48-R59 : upward |
|
R51-R64 : outward |
|
R52-R63 : outward |
|
R53-R62 : outward |
|
R58-R61 : upward pairing |
|
Number of stackings = 50 |
|
Number of adjacent stackings = 34 |
|
Number of non adjacent stackings = 16 |
|
Base-pairs |
|
R1-R72 : G-C Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX |
|
R2-R71 : G-C Ww/Ww pairing antiparallel cis one_hbond |
|
R3-R70 : C-G Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX |
|
R4-R69 : G-C Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX |
|
R5-R68 : C-G Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX |
|
R6-R67 : G-C Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX |
|
R7-R66 : U-A Ww/Ww pairing antiparallel cis XX |
|
R9-R11 : A-C O2'/Bh pairing |
|
R9-R13 : A-A Hh/Ww pairing antiparallel trans V |
|
R11-R24 : C-G Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX |
|
R12-R23 : A-U Ww/Ws pairing antiparallel cis XX |
|
R13-R22 : A-A Ss/Hw pairing antiparallel trans one_hbond 41 |
|
R14-R46 : A-A Wh/Ww pairing parallel cis one_hbond |
|
R15-R48 : G-G Bh/Ww pairing parallel trans 113 |
|
R16-R59 : C-C Ww/Ww pairing parallel trans XV |
|
R18-R57 : G-G O2'/Ww O2'/Bs inward pairing |
|
R19-R56 : G-C Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX |
|
R22-R46 : A-A O2P/Bh pairing |
|
R27-R43 : G-U Ww/Ws pairing antiparallel cis XXVIII |
|
R28-R42 : C-G Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX |
|
R29-R41 : G-C Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX |
|
R30-R40 : G-C Ws/Ww pairing antiparallel cis one_hbond |
|
R33-R35 : U-C O2'/Bh pairing |
|
R33-R36 : U-A Ws/C8 Ww/O2P pairing antiparallel trans one_hbond |
|
R49-R65 : U-A Ww/Ww pairing antiparallel cis XX |
|
R50-R64 : C-G Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX |
|
R51-R63 : C-G Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX |
|
R52-R62 : G-C Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX |
|
R53-R61 : G-C Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX |
|
R58-R61 : A-C O2'/Bh upward pairing |
|
R60-R61 : U-C O2P/Bh O2P/Bh adjacent_5p pairing |
|
R72-R73 : C-U Hw/Hw adjacent_5p pairing parallel cis one_hbond 101 |
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