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1
+ Residue conformations -------------------------------------------
2
+ M1 : G C3p_endo anti
3
+ M2 : G C3p_endo anti
4
+ M3 : U C3p_endo anti
5
+ M4 : C C3p_endo anti
6
+ M5 : A C3p_endo anti
7
+ M6 : A C3p_endo anti
8
+ M7 : A C3p_endo anti
9
+ M8 : A C3p_endo anti
10
+ M9 : U C3p_endo anti
11
+ M10 : G C3p_endo anti
12
+ M11 : C C3p_endo anti
13
+ '1'1001 : SER
14
+ '1'1002 : ILE
15
+ '1'1003 : SER
16
+ '1'1004 : GLN
17
+ '1'1005 : GLN
18
+ '1'1006 : THR
19
+ '1'1007 : VAL
20
+ '1'1008 : TRP
21
+ '1'1009 : ASN
22
+ '1'1010 : GLN
23
+ '1'1011 : MET
24
+ '1'1012 : ALA
25
+ '1'1013 : THR
26
+ '1'1014 : VAL
27
+ '1'1015 : ARG
28
+ '1'1016 : THR
29
+ '1'1017 : PRO
30
+ '1'1018 : LEU
31
+ '1'1019 : ASN
32
+ '1'1020 : PHE
33
+ '1'1021 : ASP
34
+ '1'1022 : SER
35
+ '1'1023 : SER
36
+ '1'1024 : LYS
37
+ '1'1025 : GLN
38
+ '1'1026 : SER
39
+ '1'1027 : PHE
40
+ '1'1028 : CYS
41
+ '1'1029 : GLN
42
+ '1'1030 : PHE
43
+ '1'1031 : SER
44
+ '1'1032 : VAL
45
+ '1'1033 : ASP
46
+ '1'1034 : LEU
47
+ '1'1035 : LEU
48
+ '1'1036 : GLY
49
+ '1'1037 : GLY
50
+ '1'1038 : GLY
51
+ '1'1039 : ILE
52
+ '1'1040 : SER
53
+ '1'1041 : VAL
54
+ '1'1042 : ASP
55
+ '1'1043 : LYS
56
+ '1'1044 : THR
57
+ '1'1045 : GLY
58
+ '1'1046 : ASP
59
+ '1'1047 : TRP
60
+ '1'1048 : ILE
61
+ '1'1049 : THR
62
+ '1'1050 : LEU
63
+ '1'1051 : VAL
64
+ '1'1052 : GLN
65
+ '1'1053 : ASN
66
+ '1'1054 : SER
67
+ '1'1055 : PRO
68
+ '1'1056 : ILE
69
+ '1'1057 : SER
70
+ '1'1058 : ASN
71
+ '1'1059 : LEU
72
+ '1'1060 : LEU
73
+ '1'1061 : ARG
74
+ '1'1062 : VAL
75
+ '1'1063 : ALA
76
+ '1'1064 : ALA
77
+ '1'1065 : TRP
78
+ '1'1066 : LYS
79
+ '1'1067 : LYS
80
+ '1'1068 : GLY
81
+ '1'1069 : CYS
82
+ '1'1070 : LEU
83
+ '1'1071 : MET
84
+ '1'1072 : VAL
85
+ '1'1073 : LYS
86
+ '1'1074 : VAL
87
+ '1'1075 : VAL
88
+ '1'1076 : MET
89
+ '1'1077 : SER
90
+ '1'1078 : GLY
91
+ '1'1079 : ASN
92
+ '1'1080 : ALA
93
+ '1'1081 : ALA
94
+ '1'1082 : VAL
95
+ '1'1083 : LYS
96
+ '1'1084 : ARG
97
+ '1'1085 : SER
98
+ '1'1086 : ASP
99
+ '1'1087 : TRP
100
+ '1'1088 : ALA
101
+ '1'1089 : SER
102
+ '1'1090 : LEU
103
+ '1'1091 : VAL
104
+ '1'1092 : GLN
105
+ '1'1093 : VAL
106
+ '1'1094 : PHE
107
+ '1'1095 : LEU
108
+ '1'1096 : THR
109
+ '1'1097 : ASN
110
+ '1'1098 : SER
111
+ '1'1099 : ASN
112
+ '1'1100 : SER
113
+ '1'1101 : THR
114
+ '1'1102 : GLU
115
+ '1'1103 : HIS
116
+ '1'1104 : PHE
117
+ '1'1105 : ASP
118
+ '1'1106 : ALA
119
+ '1'1107 : CYS
120
+ '1'1108 : ARG
121
+ '1'1109 : TRP
122
+ '1'1110 : THR
123
+ '1'1111 : LYS
124
+ '1'1112 : SER
125
+ '1'1113 : GLU
126
+ '1'1114 : PRO
127
+ '1'1115 : HIS
128
+ '1'1116 : SER
129
+ '1'1117 : TRP
130
+ '1'1118 : GLU
131
+ '1'1119 : LEU
132
+ '1'1120 : ILE
133
+ '1'1121 : PHE
134
+ '1'1122 : PRO
135
+ '1'1123 : ILE
136
+ '1'1124 : GLU
137
+ '1'1125 : VAL
138
+ '1'1126 : CYS
139
+ '1'1127 : GLY
140
+ '1'1128 : PRO
141
+ '1'1129 : ASN
142
+ '1'1130 : ASN
143
+ '1'1131 : GLY
144
+ '1'1132 : PHE
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+ '1'1133 : GLU
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149
+ '1'1137 : SER
150
+ '1'1138 : GLU
151
+ '1'1139 : TRP
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+ '1'1141 : ASN
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+ '1'1144 : SER
157
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159
+ '1'1147 : LEU
160
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161
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162
+ '1'1150 : LEU
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167
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168
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169
+ '1'1157 : SER
170
+ '1'1158 : THR
171
+ '1'1159 : THR
172
+ '1'1160 : PHE
173
+ '1'1161 : ASP
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176
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177
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178
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179
+ '1'1167 : SER
180
+ '1'1168 : GLN
181
+ '1'1169 : ASN
182
+ '1'1170 : PHE
183
+ '1'1171 : GLU
184
+ '1'1172 : ILE
185
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186
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197
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198
+ '2'3001 : MET
199
+ '2'3002 : GLU
200
+ '2'3003 : THR
201
+ '2'3004 : ASN
202
+ '2'3005 : LEU
203
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204
+ '2'3007 : LYS
205
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209
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210
+ '2'3013 : VAL
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+ '2'3014 : GLU
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220
+ '2'3023 : LEU
221
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222
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223
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224
+ '2'3027 : GLN
225
+ '2'3028 : SER
226
+ '2'3029 : LYS
227
+ '2'3030 : ILE
228
+ '2'3031 : ALA
229
+ '2'3032 : LEU
230
+ '2'3033 : PRO
231
+ '2'3034 : LYS
232
+ '2'3035 : ASN
233
+ '2'3036 : THR
234
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236
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237
+ '2'3040 : THR
238
+ '2'3041 : ILE
239
+ '2'3042 : LEU
240
+ '2'3043 : ARG
241
+ '2'3044 : SER
242
+ '2'3045 : ASP
243
+ '2'3046 : LEU
244
+ '2'3047 : LEU
245
+ '2'3048 : ALA
246
+ '2'3049 : ASN
247
+ '2'3050 : PHE
248
+ '2'3051 : LEU
249
+ '2'3052 : THR
250
+ '2'3053 : GLU
251
+ '2'3054 : GLY
252
+ '2'3055 : ASN
253
+ '2'3056 : PHE
254
+ '2'3057 : ARG
255
+ '2'3058 : ALA
256
+ '2'3059 : SER
257
+ '2'3060 : VAL
258
+ '2'3061 : ASP
259
+ '2'3062 : LEU
260
+ '2'3063 : GLN
261
+ '2'3064 : ARG
262
+ '2'3065 : THR
263
+ '2'3066 : HIS
264
+ '2'3067 : ARG
265
+ '2'3068 : ILE
266
+ '2'3069 : LYS
267
+ '2'3070 : GLY
268
+ '2'3071 : MET
269
+ '2'3072 : ILE
270
+ '2'3073 : LYS
271
+ '2'3074 : MET
272
+ '2'3075 : VAL
273
+ '2'3076 : ALA
274
+ '2'3077 : THR
275
+ '2'3078 : VAL
276
+ '2'3079 : GLY
277
+ '2'3080 : ILE
278
+ '2'3081 : PRO
279
+ '2'3082 : GLU
280
+ '2'3083 : ASN
281
+ '2'3084 : THR
282
+ '2'3085 : GLY
283
+ '2'3086 : ILE
284
+ '2'3087 : ALA
285
+ '2'3088 : LEU
286
+ '2'3089 : ALA
287
+ '2'3090 : CYS
288
+ '2'3091 : ALA
289
+ '2'3092 : MET
290
+ '2'3093 : ASN
291
+ '2'3094 : SER
292
+ '2'3095 : SER
293
+ '2'3096 : ILE
294
+ '2'3097 : ARG
295
+ '2'3098 : GLY
296
+ '2'3099 : ARG
297
+ '2'3100 : ALA
298
+ '2'3101 : SER
299
+ '2'3102 : SER
300
+ '2'3103 : ASP
301
+ '2'3104 : ILE
302
+ '2'3105 : TYR
303
+ '2'3106 : THR
304
+ '2'3107 : ILE
305
+ '2'3108 : CYS
306
+ '2'3109 : SER
307
+ '2'3110 : GLN
308
+ '2'3111 : ASP
309
+ '2'3112 : CYS
310
+ '2'3113 : GLU
311
+ '2'3114 : LEU
312
+ '2'3115 : TRP
313
+ '2'3116 : ASN
314
+ '2'3117 : PRO
315
+ '2'3118 : ALA
316
+ '2'3119 : CYS
317
+ '2'3120 : THR
318
+ '2'3121 : LYS
319
+ '2'3122 : ALA
320
+ '2'3123 : MET
321
+ '2'3124 : THR
322
+ '2'3125 : MET
323
+ '2'3126 : SER
324
+ '2'3127 : PHE
325
+ '2'3128 : ASN
326
+ '2'3129 : PRO
327
+ '2'3130 : ASN
328
+ '2'3131 : PRO
329
+ '2'3132 : CYS
330
+ '2'3133 : SER
331
+ '2'3134 : ASP
332
+ '2'3135 : ALA
333
+ '2'3136 : TRP
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347
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348
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349
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350
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351
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352
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353
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355
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356
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357
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360
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362
+ '2'3165 : GLN
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370
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371
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379
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+ '2'2001 : CYS
381
+ '2'2002 : VAL
382
+ '2'2003 : LEU
383
+ '2'2004 : ASN
384
+ '2'2005 : PRO
385
+ '2'2006 : GLN
386
+ '2'2007 : ASN
387
+ '2'2008 : PRO
388
+ '2'2009 : PHE
389
+ '2'2010 : VAL
390
+ '2'2011 : LEU
391
+ '2'2012 : ASN
392
+ '2'2013 : ARG
393
+ '2'2014 : TRP
394
+ '2'2015 : MET
395
+ '2'2016 : GLY
396
+ '2'2017 : LYS
397
+ '2'2018 : LEU
398
+ '2'2019 : THR
399
+ '2'2020 : PHE
400
+ '2'2021 : PRO
401
+ '2'2022 : GLN
402
+ '2'2023 : GLY
403
+ '2'2024 : THR
404
+ '2'2025 : SER
405
+ '2'2026 : ARG
406
+ '2'2027 : SER
407
+ '2'2028 : VAL
408
+ '2'2029 : LYS
409
+ '2'2030 : ARG
410
+ '2'2031 : MET
411
+ '2'2032 : PRO
412
+ '2'2033 : LEU
413
+ '2'2034 : SER
414
+ '2'2035 : ILE
415
+ '2'2036 : GLY
416
+ '2'2037 : GLY
417
+ '2'2038 : GLY
418
+ '2'2039 : ALA
419
+ '2'2040 : GLY
420
+ '2'2041 : ALA
421
+ '2'2042 : LYS
422
+ '2'2043 : SER
423
+ '2'2044 : ALA
424
+ '2'2045 : ILE
425
+ '2'2046 : LEU
426
+ '2'2047 : MET
427
+ '2'2048 : ASN
428
+ '2'2049 : MET
429
+ '2'2050 : PRO
430
+ '2'2051 : ASN
431
+ '2'2052 : ALA
432
+ '2'2053 : VAL
433
+ '2'2054 : LEU
434
+ '2'2055 : SER
435
+ '2'2056 : MET
436
+ '2'2057 : TRP
437
+ '2'2058 : ARG
438
+ '2'2059 : TYR
439
+ '2'2060 : PHE
440
+ '2'2061 : VAL
441
+ '2'2062 : GLY
442
+ '2'2063 : ASP
443
+ '2'2064 : LEU
444
+ '2'2065 : VAL
445
+ '2'2066 : PHE
446
+ '2'2067 : GLU
447
+ '2'2068 : VAL
448
+ '2'2069 : SER
449
+ '2'2070 : LYS
450
+ '2'2071 : MET
451
+ '2'2072 : THR
452
+ '2'2073 : SER
453
+ '2'2074 : PRO
454
+ '2'2075 : TYR
455
+ '2'2076 : ILE
456
+ '2'2077 : LYS
457
+ '2'2078 : CYS
458
+ '2'2079 : THR
459
+ '2'2080 : VAL
460
+ '2'2081 : SER
461
+ '2'2082 : PHE
462
+ '2'2083 : PHE
463
+ '2'2084 : ILE
464
+ '2'2085 : ALA
465
+ '2'2086 : PHE
466
+ '2'2087 : GLY
467
+ '2'2088 : ASN
468
+ '2'2089 : LEU
469
+ '2'2090 : ALA
470
+ '2'2091 : ASP
471
+ '2'2092 : ASP
472
+ '2'2093 : THR
473
+ '2'2094 : ILE
474
+ '2'2095 : ASN
475
+ '2'2096 : PHE
476
+ '2'2097 : GLU
477
+ '2'2098 : ALA
478
+ '2'2099 : PHE
479
+ '2'2100 : PRO
480
+ '2'2101 : HIS
481
+ '2'2102 : LYS
482
+ '2'2103 : LEU
483
+ '2'2104 : VAL
484
+ '2'2105 : GLN
485
+ '2'2106 : PHE
486
+ '2'2107 : GLY
487
+ '2'2108 : GLU
488
+ '2'2109 : ILE
489
+ '2'2110 : GLN
490
+ '2'2111 : GLU
491
+ '2'2112 : LYS
492
+ '2'2113 : VAL
493
+ '2'2114 : VAL
494
+ '2'2115 : LEU
495
+ '2'2116 : LYS
496
+ '2'2117 : PHE
497
+ '2'2118 : SER
498
+ '2'2119 : GLN
499
+ '2'2120 : GLU
500
+ '2'2121 : GLU
501
+ '2'2122 : PHE
502
+ '2'2123 : LEU
503
+ '2'2124 : THR
504
+ '2'2125 : ALA
505
+ '2'2126 : TRP
506
+ '2'2127 : SER
507
+ '2'2128 : THR
508
+ '2'2129 : GLN
509
+ '2'2130 : VAL
510
+ '2'2131 : ARG
511
+ '2'2132 : PRO
512
+ '2'2133 : ALA
513
+ '2'2134 : THR
514
+ '2'2135 : THR
515
+ '2'2136 : LEU
516
+ '2'2137 : LEU
517
+ '2'2138 : ALA
518
+ '2'2139 : ASP
519
+ '2'2140 : GLY
520
+ '2'2141 : CYS
521
+ '2'2142 : PRO
522
+ '2'2143 : TYR
523
+ '2'2144 : LEU
524
+ '2'2145 : TYR
525
+ '2'2146 : ALA
526
+ '2'2147 : MET
527
+ '2'2148 : VAL
528
+ '2'2149 : HIS
529
+ '2'2150 : ASP
530
+ '2'2151 : SER
531
+ '2'2152 : SER
532
+ '2'2153 : VAL
533
+ '2'2154 : SER
534
+ '2'2155 : THR
535
+ '2'2156 : ILE
536
+ '2'2157 : PRO
537
+ '2'2158 : GLY
538
+ '2'2159 : ASP
539
+ '2'2160 : PHE
540
+ '2'2161 : VAL
541
+ '2'2162 : ILE
542
+ '2'2163 : GLY
543
+ '2'2164 : VAL
544
+ '2'2165 : LYS
545
+ '2'2166 : LEU
546
+ '2'2167 : THR
547
+ '2'2168 : ILE
548
+ '2'2169 : ILE
549
+ '2'2170 : GLU
550
+ '2'2171 : ASN
551
+ '2'2172 : MET
552
+ '2'2173 : CYS
553
+ '2'2174 : ALA
554
+ '2'2175 : TYR
555
+ '2'2176 : GLY
556
+ '2'2177 : LEU
557
+ '2'2178 : ASN
558
+ '2'2179 : PRO
559
+ '2'2180 : GLY
560
+ '2'2181 : ILE
561
+ '2'2182 : SER
562
+ '2'2183 : GLY
563
+ '2'2184 : SER
564
+ '2'2185 : ARG
565
+ '2'2186 : LEU
566
+ '2'2187 : LEU
567
+ '2'2188 : GLY
568
+ '2'2189 : THR
569
+ '2'2190 : ILE
570
+ '2'2191 : PRO
571
+ '2'2192 : GLN
572
+ Adjacent stackings ----------------------------------------------
573
+ M1-M2 : adjacent_5p upward
574
+ M2-M3 : adjacent_5p upward
575
+ M3-M4 : adjacent_5p upward
576
+ M4-M5 : adjacent_5p upward
577
+ M5-M6 : adjacent_5p upward
578
+ M6-M7 : adjacent_5p upward
579
+ Non-Adjacent stackings ------------------------------------------
580
+ Number of stackings = 6
581
+ Number of adjacent stackings = 6
582
+ Number of non adjacent stackings = 0
583
+ Base-pairs ------------------------------------------------------