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  1. 157d_MC +162 -0
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@@ -0,0 +1,162 @@
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
1
+ Residue conformations -------------------------------------------
2
+ A1 : C C3p_endo anti
3
+ A2 : G C3p_endo anti
4
+ A3 : C C3p_endo anti
5
+ A4 : G C3p_endo anti
6
+ A5 : A C4p_exo anti
7
+ A6 : A C3p_endo anti
8
+ A7 : U C3p_endo anti
9
+ A8 : U C2p_exo anti
10
+ A9 : A C3p_endo anti
11
+ A10 : G C3p_endo anti
12
+ A11 : C C3p_endo anti
13
+ A12 : G C3p_endo anti
14
+ B13 : C C2p_exo anti
15
+ B14 : G C3p_endo anti
16
+ B15 : C C2p_exo anti
17
+ B16 : G C3p_endo anti
18
+ B17 : A C3p_endo anti
19
+ B18 : A C2p_exo anti
20
+ B19 : U C4p_exo anti
21
+ B20 : U C3p_endo anti
22
+ B21 : A C3p_endo anti
23
+ B22 : G C3p_endo anti
24
+ B23 : C C3p_endo anti
25
+ B24 : G C3p_endo anti
26
+ A25 : HOH
27
+ A26 : HOH
28
+ A31 : HOH
29
+ A33 : HOH
30
+ A42 : HOH
31
+ A43 : HOH
32
+ A44 : HOH
33
+ A45 : HOH
34
+ A46 : HOH
35
+ A47 : HOH
36
+ A48 : HOH
37
+ A49 : HOH
38
+ A50 : HOH
39
+ A51 : HOH
40
+ A52 : HOH
41
+ A53 : HOH
42
+ A56 : HOH
43
+ A61 : HOH
44
+ A62 : HOH
45
+ A70 : HOH
46
+ A75 : HOH
47
+ A76 : HOH
48
+ A77 : HOH
49
+ A78 : HOH
50
+ A80 : HOH
51
+ A81 : HOH
52
+ A82 : HOH
53
+ A83 : HOH
54
+ A84 : HOH
55
+ A85 : HOH
56
+ A86 : HOH
57
+ A87 : HOH
58
+ A88 : HOH
59
+ A89 : HOH
60
+ A91 : HOH
61
+ A94 : HOH
62
+ A96 : HOH
63
+ A98 : HOH
64
+ A99 : HOH
65
+ A100 : HOH
66
+ A103 : HOH
67
+ A104 : HOH
68
+ A105 : HOH
69
+ A106 : HOH
70
+ A107 : HOH
71
+ A111 : HOH
72
+ A112 : HOH
73
+ A113 : HOH
74
+ A114 : HOH
75
+ A116 : HOH
76
+ A117 : HOH
77
+ A120 : HOH
78
+ A121 : HOH
79
+ B27 : HOH
80
+ B28 : HOH
81
+ B29 : HOH
82
+ B30 : HOH
83
+ B32 : HOH
84
+ B34 : HOH
85
+ B35 : HOH
86
+ B36 : HOH
87
+ B37 : HOH
88
+ B38 : HOH
89
+ B39 : HOH
90
+ B40 : HOH
91
+ B41 : HOH
92
+ B54 : HOH
93
+ B55 : HOH
94
+ B57 : HOH
95
+ B58 : HOH
96
+ B59 : HOH
97
+ B60 : HOH
98
+ B63 : HOH
99
+ B64 : HOH
100
+ B65 : HOH
101
+ B66 : HOH
102
+ B67 : HOH
103
+ B68 : HOH
104
+ B69 : HOH
105
+ B71 : HOH
106
+ B72 : HOH
107
+ B73 : HOH
108
+ B74 : HOH
109
+ B79 : HOH
110
+ B90 : HOH
111
+ B92 : HOH
112
+ B93 : HOH
113
+ B95 : HOH
114
+ B97 : HOH
115
+ B101 : HOH
116
+ B102 : HOH
117
+ B108 : HOH
118
+ B109 : HOH
119
+ B110 : HOH
120
+ B115 : HOH
121
+ B118 : HOH
122
+ B119 : HOH
123
+ Adjacent stackings ----------------------------------------------
124
+ A2-A3 : adjacent_5p upward
125
+ A3-A4 : adjacent_5p upward
126
+ A4-A5 : adjacent_5p upward
127
+ A5-A6 : adjacent_5p upward
128
+ A6-A7 : adjacent_5p upward
129
+ A7-A8 : adjacent_5p upward
130
+ A8-A9 : adjacent_5p upward
131
+ A9-A10 : adjacent_5p upward
132
+ A10-A11 : adjacent_5p upward
133
+ A11-A12 : adjacent_5p upward
134
+ B14-B15 : adjacent_5p upward
135
+ B15-B16 : adjacent_5p upward
136
+ B16-B17 : adjacent_5p upward
137
+ B17-B18 : adjacent_5p upward
138
+ B18-B19 : adjacent_5p upward
139
+ B19-B20 : adjacent_5p upward
140
+ B20-B21 : adjacent_5p upward
141
+ B21-B22 : adjacent_5p upward
142
+ B22-B23 : adjacent_5p upward
143
+ B23-B24 : adjacent_5p upward
144
+ Non-Adjacent stackings ------------------------------------------
145
+ A2-B24 : outward
146
+ A12-B14 : outward
147
+ Number of stackings = 22
148
+ Number of adjacent stackings = 20
149
+ Number of non adjacent stackings = 2
150
+ Base-pairs ------------------------------------------------------
151
+ A1-B24 : C-G Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
152
+ A2-B23 : G-C Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
153
+ A3-B22 : C-G Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
154
+ A4-B21 : G-A Ww/Ww pairing antiparallel cis VIII
155
+ A5-B20 : A-U Ww/Ww pairing antiparallel cis XX
156
+ A6-B19 : A-U Ww/Ww pairing antiparallel cis XX
157
+ A7-B18 : U-A Ww/Ww pairing antiparallel cis XX
158
+ A8-B17 : U-A Ww/Ww pairing antiparallel cis XX
159
+ A9-B16 : A-G Ww/Ww pairing antiparallel cis VIII
160
+ A10-B15 : G-C Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
161
+ A11-B14 : C-G Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
162
+ A12-B13 : G-C Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX