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1a34_MC
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Residue conformations -------------------------------------------
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2 |
+
A13 : THR
|
3 |
+
A14 : GLY
|
4 |
+
A15 : ASP
|
5 |
+
A16 : ASN
|
6 |
+
A17 : SER
|
7 |
+
A18 : ASN
|
8 |
+
A19 : VAL
|
9 |
+
A20 : VAL
|
10 |
+
A21 : THR
|
11 |
+
A22 : MET
|
12 |
+
A23 : ILE
|
13 |
+
A24 : ARG
|
14 |
+
A25 : ALA
|
15 |
+
A26 : GLY
|
16 |
+
A27 : SER
|
17 |
+
A28 : TYR
|
18 |
+
A29 : PRO
|
19 |
+
A30 : LYS
|
20 |
+
A31 : VAL
|
21 |
+
A32 : ASN
|
22 |
+
A33 : PRO
|
23 |
+
A34 : THR
|
24 |
+
A35 : PRO
|
25 |
+
A36 : THR
|
26 |
+
A37 : TRP
|
27 |
+
A38 : VAL
|
28 |
+
A39 : ARG
|
29 |
+
A40 : ALA
|
30 |
+
A41 : ILE
|
31 |
+
A42 : PRO
|
32 |
+
A43 : PHE
|
33 |
+
A44 : GLU
|
34 |
+
A45 : VAL
|
35 |
+
A46 : SER
|
36 |
+
A47 : VAL
|
37 |
+
A48 : GLN
|
38 |
+
A49 : SER
|
39 |
+
A50 : GLY
|
40 |
+
A51 : ILE
|
41 |
+
A52 : ALA
|
42 |
+
A53 : PHE
|
43 |
+
A54 : LYS
|
44 |
+
A55 : VAL
|
45 |
+
A56 : PRO
|
46 |
+
A57 : VAL
|
47 |
+
A58 : GLY
|
48 |
+
A59 : SER
|
49 |
+
A60 : LEU
|
50 |
+
A61 : PHE
|
51 |
+
A62 : SER
|
52 |
+
A63 : ALA
|
53 |
+
A64 : ASN
|
54 |
+
A65 : PHE
|
55 |
+
A66 : ARG
|
56 |
+
A67 : THR
|
57 |
+
A68 : ASP
|
58 |
+
A69 : SER
|
59 |
+
A70 : PHE
|
60 |
+
A71 : THR
|
61 |
+
A72 : SER
|
62 |
+
A73 : VAL
|
63 |
+
A74 : THR
|
64 |
+
A75 : VAL
|
65 |
+
A76 : MET
|
66 |
+
A77 : SER
|
67 |
+
A78 : VAL
|
68 |
+
A79 : ARG
|
69 |
+
A80 : ALA
|
70 |
+
A81 : TRP
|
71 |
+
A82 : THR
|
72 |
+
A83 : GLN
|
73 |
+
A84 : LEU
|
74 |
+
A85 : THR
|
75 |
+
A86 : PRO
|
76 |
+
A87 : PRO
|
77 |
+
A88 : VAL
|
78 |
+
A89 : ASN
|
79 |
+
A90 : GLU
|
80 |
+
A91 : TYR
|
81 |
+
A92 : SER
|
82 |
+
A93 : PHE
|
83 |
+
A94 : VAL
|
84 |
+
A95 : ARG
|
85 |
+
A96 : LEU
|
86 |
+
A97 : LYS
|
87 |
+
A98 : PRO
|
88 |
+
A99 : LEU
|
89 |
+
A100 : PHE
|
90 |
+
A101 : LYS
|
91 |
+
A102 : THR
|
92 |
+
A103 : GLY
|
93 |
+
A104 : ASP
|
94 |
+
A105 : SER
|
95 |
+
A106 : THR
|
96 |
+
A107 : GLU
|
97 |
+
A108 : GLU
|
98 |
+
A109 : PHE
|
99 |
+
A110 : GLU
|
100 |
+
A111 : GLY
|
101 |
+
A112 : ARG
|
102 |
+
A113 : ALA
|
103 |
+
A114 : SER
|
104 |
+
A115 : ASN
|
105 |
+
A116 : ILE
|
106 |
+
A117 : ASN
|
107 |
+
A118 : THR
|
108 |
+
A119 : ARG
|
109 |
+
A120 : ALA
|
110 |
+
A121 : SER
|
111 |
+
A122 : VAL
|
112 |
+
A123 : GLY
|
113 |
+
A124 : TYR
|
114 |
+
A125 : ARG
|
115 |
+
A126 : ILE
|
116 |
+
A127 : PRO
|
117 |
+
A128 : THR
|
118 |
+
A129 : ASN
|
119 |
+
A130 : LEU
|
120 |
+
A131 : ARG
|
121 |
+
A132 : GLN
|
122 |
+
A133 : ASN
|
123 |
+
A134 : THR
|
124 |
+
A135 : VAL
|
125 |
+
A136 : ALA
|
126 |
+
A137 : ALA
|
127 |
+
A138 : ASP
|
128 |
+
A139 : ASN
|
129 |
+
A140 : VAL
|
130 |
+
A141 : CYS
|
131 |
+
A142 : GLU
|
132 |
+
A143 : VAL
|
133 |
+
A144 : ARG
|
134 |
+
A145 : SER
|
135 |
+
A146 : ASN
|
136 |
+
A147 : CYS
|
137 |
+
A148 : ARG
|
138 |
+
A149 : GLN
|
139 |
+
A150 : VAL
|
140 |
+
A151 : ALA
|
141 |
+
A152 : LEU
|
142 |
+
A153 : VAL
|
143 |
+
A154 : ILE
|
144 |
+
A155 : SER
|
145 |
+
A156 : CYS
|
146 |
+
A157 : CYS
|
147 |
+
A158 : PHE
|
148 |
+
A159 : ASN
|
149 |
+
B1 : A C3p_endo anti
|
150 |
+
B2 : A C3p_endo anti
|
151 |
+
B3 : A C3p_endo anti
|
152 |
+
B4 : A C3p_endo anti
|
153 |
+
B5 : A C3p_endo anti
|
154 |
+
B6 : A C3p_endo anti
|
155 |
+
B7 : A C3p_endo anti
|
156 |
+
B8 : A C3p_endo anti
|
157 |
+
B9 : A C3p_endo anti
|
158 |
+
B10 : A C3p_endo anti
|
159 |
+
C1 : U C2p_exo anti
|
160 |
+
C2 : U C3p_endo anti
|
161 |
+
C3 : U C3p_endo anti
|
162 |
+
C4 : U C3p_endo anti
|
163 |
+
C5 : U C3p_endo anti
|
164 |
+
C6 : U C3p_endo anti
|
165 |
+
C7 : U C3p_endo anti
|
166 |
+
C8 : U C3p_endo anti
|
167 |
+
C9 : U C3p_endo anti
|
168 |
+
C10 : U C3p_endo anti
|
169 |
+
A3001 : SO4
|
170 |
+
B11 : U C2p_endo unknown
|
171 |
+
A2001 : HOH
|
172 |
+
A2002 : HOH
|
173 |
+
A2003 : HOH
|
174 |
+
A2004 : HOH
|
175 |
+
A2005 : HOH
|
176 |
+
A2006 : HOH
|
177 |
+
A2007 : HOH
|
178 |
+
A2008 : HOH
|
179 |
+
A2009 : HOH
|
180 |
+
A2010 : HOH
|
181 |
+
A2011 : HOH
|
182 |
+
A2012 : HOH
|
183 |
+
A2013 : HOH
|
184 |
+
A2014 : HOH
|
185 |
+
A2015 : HOH
|
186 |
+
A2016 : HOH
|
187 |
+
A2017 : HOH
|
188 |
+
A2018 : HOH
|
189 |
+
A2019 : HOH
|
190 |
+
A2020 : HOH
|
191 |
+
A2021 : HOH
|
192 |
+
A2022 : HOH
|
193 |
+
A2023 : HOH
|
194 |
+
A2024 : HOH
|
195 |
+
A2101 : HOH
|
196 |
+
A2102 : HOH
|
197 |
+
A2103 : HOH
|
198 |
+
A2104 : HOH
|
199 |
+
A2105 : HOH
|
200 |
+
A2106 : HOH
|
201 |
+
A2107 : HOH
|
202 |
+
A2108 : HOH
|
203 |
+
A2109 : HOH
|
204 |
+
A2110 : HOH
|
205 |
+
A2111 : HOH
|
206 |
+
A2112 : HOH
|
207 |
+
A2113 : HOH
|
208 |
+
A2114 : HOH
|
209 |
+
A2115 : HOH
|
210 |
+
A2116 : HOH
|
211 |
+
A2117 : HOH
|
212 |
+
A2118 : HOH
|
213 |
+
A2119 : HOH
|
214 |
+
A2120 : HOH
|
215 |
+
A2121 : HOH
|
216 |
+
A2122 : HOH
|
217 |
+
A2123 : HOH
|
218 |
+
A2124 : HOH
|
219 |
+
A2125 : HOH
|
220 |
+
A2126 : HOH
|
221 |
+
A2127 : HOH
|
222 |
+
A2128 : HOH
|
223 |
+
A2129 : HOH
|
224 |
+
A2130 : HOH
|
225 |
+
A2131 : HOH
|
226 |
+
A2132 : HOH
|
227 |
+
A2133 : HOH
|
228 |
+
A2134 : HOH
|
229 |
+
A2135 : HOH
|
230 |
+
A2136 : HOH
|
231 |
+
A2137 : HOH
|
232 |
+
A2138 : HOH
|
233 |
+
A2139 : HOH
|
234 |
+
A2140 : HOH
|
235 |
+
A2141 : HOH
|
236 |
+
A2142 : HOH
|
237 |
+
A2143 : HOH
|
238 |
+
A2144 : HOH
|
239 |
+
A2145 : HOH
|
240 |
+
A2146 : HOH
|
241 |
+
A2147 : HOH
|
242 |
+
A2148 : HOH
|
243 |
+
A2149 : HOH
|
244 |
+
A2150 : HOH
|
245 |
+
A2151 : HOH
|
246 |
+
A2152 : HOH
|
247 |
+
A2153 : HOH
|
248 |
+
A2154 : HOH
|
249 |
+
A2155 : HOH
|
250 |
+
A2156 : HOH
|
251 |
+
A2157 : HOH
|
252 |
+
A2158 : HOH
|
253 |
+
A2159 : HOH
|
254 |
+
A2160 : HOH
|
255 |
+
A2161 : HOH
|
256 |
+
A2162 : HOH
|
257 |
+
A2163 : HOH
|
258 |
+
A2164 : HOH
|
259 |
+
A2165 : HOH
|
260 |
+
A2166 : HOH
|
261 |
+
A2167 : HOH
|
262 |
+
A2168 : HOH
|
263 |
+
A2169 : HOH
|
264 |
+
A2170 : HOH
|
265 |
+
A2171 : HOH
|
266 |
+
A2172 : HOH
|
267 |
+
A2173 : HOH
|
268 |
+
A2174 : HOH
|
269 |
+
A2175 : HOH
|
270 |
+
A2176 : HOH
|
271 |
+
A2177 : HOH
|
272 |
+
A2178 : HOH
|
273 |
+
A2179 : HOH
|
274 |
+
A2180 : HOH
|
275 |
+
A2181 : HOH
|
276 |
+
A2182 : HOH
|
277 |
+
A2183 : HOH
|
278 |
+
A2184 : HOH
|
279 |
+
A2185 : HOH
|
280 |
+
A2186 : HOH
|
281 |
+
A2187 : HOH
|
282 |
+
A2188 : HOH
|
283 |
+
A2189 : HOH
|
284 |
+
A2190 : HOH
|
285 |
+
A2191 : HOH
|
286 |
+
A2192 : HOH
|
287 |
+
A2193 : HOH
|
288 |
+
A2194 : HOH
|
289 |
+
A2195 : HOH
|
290 |
+
A2196 : HOH
|
291 |
+
A2197 : HOH
|
292 |
+
A2198 : HOH
|
293 |
+
A2199 : HOH
|
294 |
+
A2207 : HOH
|
295 |
+
A2301 : HOH
|
296 |
+
A2302 : HOH
|
297 |
+
A2303 : HOH
|
298 |
+
A2304 : HOH
|
299 |
+
A2305 : HOH
|
300 |
+
A2306 : HOH
|
301 |
+
A2401 : HOH
|
302 |
+
A2402 : HOH
|
303 |
+
A2403 : HOH
|
304 |
+
A2404 : HOH
|
305 |
+
A2405 : HOH
|
306 |
+
A2501 : HOH
|
307 |
+
A2502 : HOH
|
308 |
+
A2503 : HOH
|
309 |
+
A2504 : HOH
|
310 |
+
A2505 : HOH
|
311 |
+
A2506 : HOH
|
312 |
+
A2507 : HOH
|
313 |
+
A2508 : HOH
|
314 |
+
A2509 : HOH
|
315 |
+
A2601 : HOH
|
316 |
+
A2606 : HOH
|
317 |
+
A2607 : HOH
|
318 |
+
A2701 : HOH
|
319 |
+
A2901 : HOH
|
320 |
+
B2201 : HOH
|
321 |
+
B2202 : HOH
|
322 |
+
B2203 : HOH
|
323 |
+
B2204 : HOH
|
324 |
+
B2210 : HOH
|
325 |
+
B2211 : HOH
|
326 |
+
B2602 : HOH
|
327 |
+
B2603 : HOH
|
328 |
+
B2604 : HOH
|
329 |
+
B2605 : HOH
|
330 |
+
B2801 : HOH
|
331 |
+
C2205 : HOH
|
332 |
+
C2206 : HOH
|
333 |
+
C2208 : HOH
|
334 |
+
C2209 : HOH
|
335 |
+
C2212 : HOH
|
336 |
+
C2608 : HOH
|
337 |
+
C2609 : HOH
|
338 |
+
C2610 : HOH
|
339 |
+
Adjacent stackings ----------------------------------------------
|
340 |
+
B1-B2 : adjacent_5p upward
|
341 |
+
B2-B3 : adjacent_5p upward
|
342 |
+
B3-B4 : adjacent_5p upward
|
343 |
+
B4-B5 : adjacent_5p upward
|
344 |
+
B5-B6 : adjacent_5p upward
|
345 |
+
B6-B7 : adjacent_5p upward
|
346 |
+
B7-B8 : adjacent_5p upward
|
347 |
+
B8-B9 : adjacent_5p upward
|
348 |
+
C1-C2 : adjacent_5p upward
|
349 |
+
C4-C5 : adjacent_5p upward
|
350 |
+
C5-C6 : adjacent_5p upward
|
351 |
+
C6-C7 : adjacent_5p upward
|
352 |
+
C7-C8 : adjacent_5p upward
|
353 |
+
Non-Adjacent stackings ------------------------------------------
|
354 |
+
Number of stackings = 13
|
355 |
+
Number of adjacent stackings = 13
|
356 |
+
Number of non adjacent stackings = 0
|
357 |
+
Base-pairs ------------------------------------------------------
|
358 |
+
B1-C9 : A-U Ww/Ww pairing antiparallel cis XX
|
359 |
+
B3-C7 : A-U Ww/Ww pairing antiparallel cis XX
|
360 |
+
B4-C6 : A-U Ww/Ww pairing antiparallel cis XX
|
361 |
+
B5-C5 : A-U Ww/Ww pairing antiparallel cis XX
|
362 |
+
B6-C4 : A-U Ww/Ww pairing antiparallel cis XX
|
363 |
+
B7-C3 : A-U Ww/Ww pairing antiparallel cis XX
|
364 |
+
B8-C2 : A-U Ww/Ww pairing antiparallel cis XX
|
365 |
+
B9-C1 : A-U Ww/Ww pairing antiparallel cis XX
|