Residue conformations -------------------------------------------
A1 : G C3p_endo anti
A2 : C C3p_endo anti
A3 : U C3p_endo anti
A4 : U C3p_endo anti
A5 : C C3p_endo anti
A6 : G C3p_endo anti
A7 : G C3p_endo anti
A8 : C C3p_endo anti
A9 : BRU
B10 : G C3p_endo anti
B11 : C C3p_endo anti
B12 : U C3p_endo anti
B13 : U C2p_exo anti
B14 : C C3p_endo anti
B15 : G C3p_endo anti
B16 : G C3p_endo anti
B17 : C C3p_endo anti
B18 : BRU
A19 : RHD
A20 : RHD
A22 : RHD
B21 : RHD
A23 : HOH
A25 : HOH
A26 : HOH
A27 : HOH
A28 : HOH
A29 : HOH
A30 : HOH
A31 : HOH
A33 : HOH
A35 : HOH
A36 : HOH
A37 : HOH
A38 : HOH
A41 : HOH
A43 : HOH
A47 : HOH
A48 : HOH
A51 : HOH
A53 : HOH
A54 : HOH
A56 : HOH
A57 : HOH
A59 : HOH
A60 : HOH
A61 : HOH
A63 : HOH
A64 : HOH
A65 : HOH
A66 : HOH
A73 : HOH
A74 : HOH
B24 : HOH
B32 : HOH
B34 : HOH
B39 : HOH
B40 : HOH
B42 : HOH
B44 : HOH
B45 : HOH
B46 : HOH
B49 : HOH
B50 : HOH
B52 : HOH
B55 : HOH
B58 : HOH
B62 : HOH
B67 : HOH
B68 : HOH
B69 : HOH
B70 : HOH
B71 : HOH
B72 : HOH
B75 : HOH
B76 : HOH
Adjacent stackings ----------------------------------------------
A1-A2 : adjacent_5p upward 
A2-A3 : adjacent_5p upward 
A4-A5 : adjacent_5p upward 
A5-A6 : adjacent_5p upward 
A6-A7 : adjacent_5p upward 
A7-A8 : adjacent_5p upward 
B10-B11 : adjacent_5p upward 
B11-B12 : adjacent_5p upward 
B13-B14 : adjacent_5p upward 
B14-B15 : adjacent_5p upward 
B15-B16 : adjacent_5p upward 
B16-B17 : adjacent_5p upward 
Non-Adjacent stackings ------------------------------------------
Number of stackings = 12
Number of adjacent stackings = 12
Number of non adjacent stackings = 0
Base-pairs ------------------------------------------------------
A1-B17 : G-C Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX 
A2-B16 : C-G Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX 
A3-B15 : U-G Ws/Ww pairing antiparallel cis XXVIII 
A4-B14 : U-C Wh/Wh pairing antiparallel cis one_hbond 
A5-B13 : C-U Wh/Wh pairing antiparallel cis one_hbond 
A6-B12 : G-U Ww/Ws pairing antiparallel cis XXVIII 
A7-B11 : G-C Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX 
A8-B10 : C-G Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX