bioCIF / 1a34_MC
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Residue conformations -------------------------------------------
A13 : THR
A14 : GLY
A15 : ASP
A16 : ASN
A17 : SER
A18 : ASN
A19 : VAL
A20 : VAL
A21 : THR
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A137 : ALA
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A143 : VAL
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A156 : CYS
A157 : CYS
A158 : PHE
A159 : ASN
B1 : A C3p_endo anti
B2 : A C3p_endo anti
B3 : A C3p_endo anti
B4 : A C3p_endo anti
B5 : A C3p_endo anti
B6 : A C3p_endo anti
B7 : A C3p_endo anti
B8 : A C3p_endo anti
B9 : A C3p_endo anti
B10 : A C3p_endo anti
C1 : U C2p_exo anti
C2 : U C3p_endo anti
C3 : U C3p_endo anti
C4 : U C3p_endo anti
C5 : U C3p_endo anti
C6 : U C3p_endo anti
C7 : U C3p_endo anti
C8 : U C3p_endo anti
C9 : U C3p_endo anti
C10 : U C3p_endo anti
A3001 : SO4
B11 : U C2p_endo unknown
A2001 : HOH
A2002 : HOH
A2003 : HOH
A2004 : HOH
A2005 : HOH
A2006 : HOH
A2007 : HOH
A2008 : HOH
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A2011 : HOH
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A2015 : HOH
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A2017 : HOH
A2018 : HOH
A2019 : HOH
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A2022 : HOH
A2023 : HOH
A2024 : HOH
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A2102 : HOH
A2103 : HOH
A2104 : HOH
A2105 : HOH
A2106 : HOH
A2107 : HOH
A2108 : HOH
A2109 : HOH
A2110 : HOH
A2111 : HOH
A2112 : HOH
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A2128 : HOH
A2129 : HOH
A2130 : HOH
A2131 : HOH
A2132 : HOH
A2133 : HOH
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A2136 : HOH
A2137 : HOH
A2138 : HOH
A2139 : HOH
A2140 : HOH
A2141 : HOH
A2142 : HOH
A2143 : HOH
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A2145 : HOH
A2146 : HOH
A2147 : HOH
A2148 : HOH
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A2187 : HOH
A2188 : HOH
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A2190 : HOH
A2191 : HOH
A2192 : HOH
A2193 : HOH
A2194 : HOH
A2195 : HOH
A2196 : HOH
A2197 : HOH
A2198 : HOH
A2199 : HOH
A2207 : HOH
A2301 : HOH
A2302 : HOH
A2303 : HOH
A2304 : HOH
A2305 : HOH
A2306 : HOH
A2401 : HOH
A2402 : HOH
A2403 : HOH
A2404 : HOH
A2405 : HOH
A2501 : HOH
A2502 : HOH
A2503 : HOH
A2504 : HOH
A2505 : HOH
A2506 : HOH
A2507 : HOH
A2508 : HOH
A2509 : HOH
A2601 : HOH
A2606 : HOH
A2607 : HOH
A2701 : HOH
A2901 : HOH
B2201 : HOH
B2202 : HOH
B2203 : HOH
B2204 : HOH
B2210 : HOH
B2211 : HOH
B2602 : HOH
B2603 : HOH
B2604 : HOH
B2605 : HOH
B2801 : HOH
C2205 : HOH
C2206 : HOH
C2208 : HOH
C2209 : HOH
C2212 : HOH
C2608 : HOH
C2609 : HOH
C2610 : HOH
Adjacent stackings ----------------------------------------------
B1-B2 : adjacent_5p upward
B2-B3 : adjacent_5p upward
B3-B4 : adjacent_5p upward
B4-B5 : adjacent_5p upward
B5-B6 : adjacent_5p upward
B6-B7 : adjacent_5p upward
B7-B8 : adjacent_5p upward
B8-B9 : adjacent_5p upward
C1-C2 : adjacent_5p upward
C4-C5 : adjacent_5p upward
C5-C6 : adjacent_5p upward
C6-C7 : adjacent_5p upward
C7-C8 : adjacent_5p upward
Non-Adjacent stackings ------------------------------------------
Number of stackings = 13
Number of adjacent stackings = 13
Number of non adjacent stackings = 0
Base-pairs ------------------------------------------------------
B1-C9 : A-U Ww/Ww pairing antiparallel cis XX
B3-C7 : A-U Ww/Ww pairing antiparallel cis XX
B4-C6 : A-U Ww/Ww pairing antiparallel cis XX
B5-C5 : A-U Ww/Ww pairing antiparallel cis XX
B6-C4 : A-U Ww/Ww pairing antiparallel cis XX
B7-C3 : A-U Ww/Ww pairing antiparallel cis XX
B8-C2 : A-U Ww/Ww pairing antiparallel cis XX
B9-C1 : A-U Ww/Ww pairing antiparallel cis XX