|
Residue conformations |
|
A13 : THR |
|
A14 : GLY |
|
A15 : ASP |
|
A16 : ASN |
|
A17 : SER |
|
A18 : ASN |
|
A19 : VAL |
|
A20 : VAL |
|
A21 : THR |
|
A22 : MET |
|
A23 : ILE |
|
A24 : ARG |
|
A25 : ALA |
|
A26 : GLY |
|
A27 : SER |
|
A28 : TYR |
|
A29 : PRO |
|
A30 : LYS |
|
A31 : VAL |
|
A32 : ASN |
|
A33 : PRO |
|
A34 : THR |
|
A35 : PRO |
|
A36 : THR |
|
A37 : TRP |
|
A38 : VAL |
|
A39 : ARG |
|
A40 : ALA |
|
A41 : ILE |
|
A42 : PRO |
|
A43 : PHE |
|
A44 : GLU |
|
A45 : VAL |
|
A46 : SER |
|
A47 : VAL |
|
A48 : GLN |
|
A49 : SER |
|
A50 : GLY |
|
A51 : ILE |
|
A52 : ALA |
|
A53 : PHE |
|
A54 : LYS |
|
A55 : VAL |
|
A56 : PRO |
|
A57 : VAL |
|
A58 : GLY |
|
A59 : SER |
|
A60 : LEU |
|
A61 : PHE |
|
A62 : SER |
|
A63 : ALA |
|
A64 : ASN |
|
A65 : PHE |
|
A66 : ARG |
|
A67 : THR |
|
A68 : ASP |
|
A69 : SER |
|
A70 : PHE |
|
A71 : THR |
|
A72 : SER |
|
A73 : VAL |
|
A74 : THR |
|
A75 : VAL |
|
A76 : MET |
|
A77 : SER |
|
A78 : VAL |
|
A79 : ARG |
|
A80 : ALA |
|
A81 : TRP |
|
A82 : THR |
|
A83 : GLN |
|
A84 : LEU |
|
A85 : THR |
|
A86 : PRO |
|
A87 : PRO |
|
A88 : VAL |
|
A89 : ASN |
|
A90 : GLU |
|
A91 : TYR |
|
A92 : SER |
|
A93 : PHE |
|
A94 : VAL |
|
A95 : ARG |
|
A96 : LEU |
|
A97 : LYS |
|
A98 : PRO |
|
A99 : LEU |
|
A100 : PHE |
|
A101 : LYS |
|
A102 : THR |
|
A103 : GLY |
|
A104 : ASP |
|
A105 : SER |
|
A106 : THR |
|
A107 : GLU |
|
A108 : GLU |
|
A109 : PHE |
|
A110 : GLU |
|
A111 : GLY |
|
A112 : ARG |
|
A113 : ALA |
|
A114 : SER |
|
A115 : ASN |
|
A116 : ILE |
|
A117 : ASN |
|
A118 : THR |
|
A119 : ARG |
|
A120 : ALA |
|
A121 : SER |
|
A122 : VAL |
|
A123 : GLY |
|
A124 : TYR |
|
A125 : ARG |
|
A126 : ILE |
|
A127 : PRO |
|
A128 : THR |
|
A129 : ASN |
|
A130 : LEU |
|
A131 : ARG |
|
A132 : GLN |
|
A133 : ASN |
|
A134 : THR |
|
A135 : VAL |
|
A136 : ALA |
|
A137 : ALA |
|
A138 : ASP |
|
A139 : ASN |
|
A140 : VAL |
|
A141 : CYS |
|
A142 : GLU |
|
A143 : VAL |
|
A144 : ARG |
|
A145 : SER |
|
A146 : ASN |
|
A147 : CYS |
|
A148 : ARG |
|
A149 : GLN |
|
A150 : VAL |
|
A151 : ALA |
|
A152 : LEU |
|
A153 : VAL |
|
A154 : ILE |
|
A155 : SER |
|
A156 : CYS |
|
A157 : CYS |
|
A158 : PHE |
|
A159 : ASN |
|
B1 : A C3p_endo anti |
|
B2 : A C3p_endo anti |
|
B3 : A C3p_endo anti |
|
B4 : A C3p_endo anti |
|
B5 : A C3p_endo anti |
|
B6 : A C3p_endo anti |
|
B7 : A C3p_endo anti |
|
B8 : A C3p_endo anti |
|
B9 : A C3p_endo anti |
|
B10 : A C3p_endo anti |
|
C1 : U C2p_exo anti |
|
C2 : U C3p_endo anti |
|
C3 : U C3p_endo anti |
|
C4 : U C3p_endo anti |
|
C5 : U C3p_endo anti |
|
C6 : U C3p_endo anti |
|
C7 : U C3p_endo anti |
|
C8 : U C3p_endo anti |
|
C9 : U C3p_endo anti |
|
C10 : U C3p_endo anti |
|
A3001 : SO4 |
|
B11 : U C2p_endo unknown |
|
A2001 : HOH |
|
A2002 : HOH |
|
A2003 : HOH |
|
A2004 : HOH |
|
A2005 : HOH |
|
A2006 : HOH |
|
A2007 : HOH |
|
A2008 : HOH |
|
A2009 : HOH |
|
A2010 : HOH |
|
A2011 : HOH |
|
A2012 : HOH |
|
A2013 : HOH |
|
A2014 : HOH |
|
A2015 : HOH |
|
A2016 : HOH |
|
A2017 : HOH |
|
A2018 : HOH |
|
A2019 : HOH |
|
A2020 : HOH |
|
A2021 : HOH |
|
A2022 : HOH |
|
A2023 : HOH |
|
A2024 : HOH |
|
A2101 : HOH |
|
A2102 : HOH |
|
A2103 : HOH |
|
A2104 : HOH |
|
A2105 : HOH |
|
A2106 : HOH |
|
A2107 : HOH |
|
A2108 : HOH |
|
A2109 : HOH |
|
A2110 : HOH |
|
A2111 : HOH |
|
A2112 : HOH |
|
A2113 : HOH |
|
A2114 : HOH |
|
A2115 : HOH |
|
A2116 : HOH |
|
A2117 : HOH |
|
A2118 : HOH |
|
A2119 : HOH |
|
A2120 : HOH |
|
A2121 : HOH |
|
A2122 : HOH |
|
A2123 : HOH |
|
A2124 : HOH |
|
A2125 : HOH |
|
A2126 : HOH |
|
A2127 : HOH |
|
A2128 : HOH |
|
A2129 : HOH |
|
A2130 : HOH |
|
A2131 : HOH |
|
A2132 : HOH |
|
A2133 : HOH |
|
A2134 : HOH |
|
A2135 : HOH |
|
A2136 : HOH |
|
A2137 : HOH |
|
A2138 : HOH |
|
A2139 : HOH |
|
A2140 : HOH |
|
A2141 : HOH |
|
A2142 : HOH |
|
A2143 : HOH |
|
A2144 : HOH |
|
A2145 : HOH |
|
A2146 : HOH |
|
A2147 : HOH |
|
A2148 : HOH |
|
A2149 : HOH |
|
A2150 : HOH |
|
A2151 : HOH |
|
A2152 : HOH |
|
A2153 : HOH |
|
A2154 : HOH |
|
A2155 : HOH |
|
A2156 : HOH |
|
A2157 : HOH |
|
A2158 : HOH |
|
A2159 : HOH |
|
A2160 : HOH |
|
A2161 : HOH |
|
A2162 : HOH |
|
A2163 : HOH |
|
A2164 : HOH |
|
A2165 : HOH |
|
A2166 : HOH |
|
A2167 : HOH |
|
A2168 : HOH |
|
A2169 : HOH |
|
A2170 : HOH |
|
A2171 : HOH |
|
A2172 : HOH |
|
A2173 : HOH |
|
A2174 : HOH |
|
A2175 : HOH |
|
A2176 : HOH |
|
A2177 : HOH |
|
A2178 : HOH |
|
A2179 : HOH |
|
A2180 : HOH |
|
A2181 : HOH |
|
A2182 : HOH |
|
A2183 : HOH |
|
A2184 : HOH |
|
A2185 : HOH |
|
A2186 : HOH |
|
A2187 : HOH |
|
A2188 : HOH |
|
A2189 : HOH |
|
A2190 : HOH |
|
A2191 : HOH |
|
A2192 : HOH |
|
A2193 : HOH |
|
A2194 : HOH |
|
A2195 : HOH |
|
A2196 : HOH |
|
A2197 : HOH |
|
A2198 : HOH |
|
A2199 : HOH |
|
A2207 : HOH |
|
A2301 : HOH |
|
A2302 : HOH |
|
A2303 : HOH |
|
A2304 : HOH |
|
A2305 : HOH |
|
A2306 : HOH |
|
A2401 : HOH |
|
A2402 : HOH |
|
A2403 : HOH |
|
A2404 : HOH |
|
A2405 : HOH |
|
A2501 : HOH |
|
A2502 : HOH |
|
A2503 : HOH |
|
A2504 : HOH |
|
A2505 : HOH |
|
A2506 : HOH |
|
A2507 : HOH |
|
A2508 : HOH |
|
A2509 : HOH |
|
A2601 : HOH |
|
A2606 : HOH |
|
A2607 : HOH |
|
A2701 : HOH |
|
A2901 : HOH |
|
B2201 : HOH |
|
B2202 : HOH |
|
B2203 : HOH |
|
B2204 : HOH |
|
B2210 : HOH |
|
B2211 : HOH |
|
B2602 : HOH |
|
B2603 : HOH |
|
B2604 : HOH |
|
B2605 : HOH |
|
B2801 : HOH |
|
C2205 : HOH |
|
C2206 : HOH |
|
C2208 : HOH |
|
C2209 : HOH |
|
C2212 : HOH |
|
C2608 : HOH |
|
C2609 : HOH |
|
C2610 : HOH |
|
Adjacent stackings |
|
B1-B2 : adjacent_5p upward |
|
B2-B3 : adjacent_5p upward |
|
B3-B4 : adjacent_5p upward |
|
B4-B5 : adjacent_5p upward |
|
B5-B6 : adjacent_5p upward |
|
B6-B7 : adjacent_5p upward |
|
B7-B8 : adjacent_5p upward |
|
B8-B9 : adjacent_5p upward |
|
C1-C2 : adjacent_5p upward |
|
C4-C5 : adjacent_5p upward |
|
C5-C6 : adjacent_5p upward |
|
C6-C7 : adjacent_5p upward |
|
C7-C8 : adjacent_5p upward |
|
Non-Adjacent stackings |
|
Number of stackings = 13 |
|
Number of adjacent stackings = 13 |
|
Number of non adjacent stackings = 0 |
|
Base-pairs |
|
B1-C9 : A-U Ww/Ww pairing antiparallel cis XX |
|
B3-C7 : A-U Ww/Ww pairing antiparallel cis XX |
|
B4-C6 : A-U Ww/Ww pairing antiparallel cis XX |
|
B5-C5 : A-U Ww/Ww pairing antiparallel cis XX |
|
B6-C4 : A-U Ww/Ww pairing antiparallel cis XX |
|
B7-C3 : A-U Ww/Ww pairing antiparallel cis XX |
|
B8-C2 : A-U Ww/Ww pairing antiparallel cis XX |
|
B9-C1 : A-U Ww/Ww pairing antiparallel cis XX |
|
|
